Одним из основных направлений реформы является переход от четырёхзвенной системы управления «военный округ» — «армия» — «дивизия» — «полк» к трёхзвенной «военный округ» — «оперативное командование» — «бригада».
Численность воинских частей планируется сократить согласно следующей таблице:
| Вид ВС | 2008 год | 2012 год | Степень сокращения |
| Сухопутные войска | 1890 | 172 | 90% |
| Военно- воздушные силы | 340 | 180 | 48% |
| Военно-морской флот | 240 | 123 | 49% |
| РВСН | 12 | 8 | 33% |
| Военно- космические войска | 7 | 6 | 15% |
| Воздушно-десантные войска | 6 | 5 | 17% |
В ходе преобразования планируется расформировать 2-ю гвардейскую мотострелковую Таманскую дивизию, 4-ю гвардейскую танковую Кантемировскую дивизию, 106-ю гвардейскую воздушно-десантную дивизию и 98-ю гвардейскую воздушно-десантную Свирскую дивизию
Сокращение численности
Существенной частью реформы станет сокращение численности вооружённых сил, которая в настоящее время составляет около 1,2 млн человек. Большая часть сокращений придётся на офицерский состав: с более чем 300 тысяч до 150 тысяч человек.
Сокращения по категориям военнослужащих представлена в таблице
| Категория военнослужащих | 2008 год | 2012 год | Степень сокращения |
| Генерал | 1107 | 886 | 20% |
| Полковник | 25665 | 9114 | 65% |
| Майор | 99550 | 25000 | 75% |
| Капитан | 90000 | 40000 | 54% |
| Прапорщик/Мичман | 140000 | 0 | 100% |
В тоже время число лейтенантов должно увеличиться с 50000 до 60000 человек.
Таким образом, к 2012 году численность Вооружённых сил России должна составить 1 миллион военнослужащих, из которых 150 тысяч человек составят офицеры.
Военная медицина
Планируется сократить Государственный институт усовершенствования врачей Минобороны, 66 военных госпиталей, 83 военные поликлиники, 17 лазаретов, пять военных санаториев и домов отдыха, 64 базы хранения военной техники и имущества. В 2010—2011 году будут расформированы военно-медицинские факультеты в Самарском, Саратовском и Томском медицинском институтах.
Число врачей-офицеров планируется сократить с 7967 до 2200 человек.
Военные ВУЗы
Из 15 военных академий, 46 военных институтов и училищ и четырёх военных университетов планируется сформировать 10 научных центров. В частности планируется расформировать Академию воздушно-космической обороны имени Г.К.Жукова
В интервью журналистам Министр обороны Анатолий Сердюков сообщил
На базе 65 вузов будут созданы научные центры, где будет собрано в единое учебный процесс и научная деятельность. В новых научных центрах будет создана абсолютно новая техническая база
Военные воспитатели
Согласно директиве Генерального штаба от 22 ноября № 314/3382 число военнослужащих органов воспитательной работы должно сократится с 17490 человек до 4916, т.е. на 71%.
Изменение состава
К концу 2009 года планируется упразднить институт прапорщиков и мичманов.
Институт прапорщиков и мичманов, по мнению руководства Минобороны, не вписывается в современный облик российской армии, где приоритетом должен стать высокопрофессиональный сержантский корпус из числа контрактников, формирование которого начнется в 2009 году
Перевооружение
В газете «Красная звезда» от 2 октября 2008 года начальник вооружения Вооруженных Сил РФ — заместитель министра обороны Российской Федерации генерал-полковник Владимир Поповкин отметил, что Вооруженные силы России полностью выработали запас вооружения и военной техники, оставшихся от СССР, в связи с чем необходимо ускорить оснащение ВС новыми, современными образцами вооружений[
19 ноября 2008 года начальник Генерального штаба ВС РФ генерал армии Николай Макаров заявил журналистам, что в российской армии в ближайшие 3-5 лет будут на треть обновлены вооружение и техника, а к 2020 году это будет сделано на 100%.
